产品货号:
KL00202
中文名称:
防污染LAMP试剂盒(双染料法)
英文名称:
Universal UNG LAMP kit
产品规格:
50T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是整合UNG-dUTP防污染系统、可视化LAMP、荧光染料LAMP而成的产品。
保存:-20℃,有效期1年。
一、样品DNA的制备
二、配制并测试自备的20×LAMP引物混合液
三、LAMP扩增(20μL体系)
四、可视化结果分析及解读
五、荧光染料法结果分析及解读
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- UNG-dUTP系统可以防止扩增产品对后续实验的污染(如果后续实验也使用本制品的话,如果后续实验使用不含UNG-dUTP的试剂盒,则无效果)。
- UNG-dUTP系统为内源式,不需要增加任何操作步骤。
- 65℃恒温扩增,不需要贵重的仪器设备,只需要恒温水浴或金属浴。
- 一般60分钟内出结果(具体时间取决于靶分子的浓度)。
- 最大样品加样量高达到14μL(对20μL的反应体系),减少了漏检机率。
- 含可视化染料和荧光染料,故既可以用肉眼终点判断结果(终点法可视化LAMP),也可用荧光PCR仪进行实时荧光检测(实时荧光LAMP)。
- 灵敏性可达10拷贝/反应以下(跟引物设计密切相关),故假阴性率更低。
- 只能进行定性检测,不建议用于定量检测。
- 本制品足够50次20μL体系的荧光及可视化LAMP扩增。
- 本制品只能用于科研。
组分 | 规格 |
4×UNG-LAMP MasterMix(双染料法) | 200μL |
Bst 3.0-UNG混合液 | 50μL |
LAMP阳性对照模板-引物混合物干粉 | 1支 |
保存:-20℃,有效期1年。
- LAMP阳性对照模板-引物混合物干粉干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入55μL的超纯水充分混匀和再使用,未用完的需要-20℃保存。
- 如果使用水浴锅或金属浴,需要在实验启动前打开并调到65℃。如果用金属浴,还必须在孔中加水以填充金属孔和反应管间的空隙。本公司发现很多水浴锅或金属浴温度显示根本不准,故建议先用阳性对照和阴性对照测试所用仪器在60℃、62.5℃、65℃、67.5℃和70℃五个温度下扩增效果,最后选择阳性和阴性颜色差异最大的温度进行扩增。不要轻易更换恒温设备。
一、样品DNA的制备
- 用自选方法纯化样品DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的各种免提取的核酸释放剂。
- 如果有N个样品,则至少需要做N+2个样品制备,多出的两个一个是样品制备阳性对照(制备时加入自备的、跟要检测的靶分子相同的阳性对照模板,一起经历提取过程)和一个样品制备阴性对照(用水替代样品)。最后N+2个样品一起进行DNA提取操作,得到N+2个DNA样品。
二、配制并测试自备的20×LAMP引物混合液
- 用超纯水将自备的6种(或4种)LAMP引物干粉分别稀释到100μM,然后按下表配制100μL的20×LAMP引物混合液,此混合液足够100次20μL体系的LAMP扩增。如果需要配制的引物混合液体积异于100μL,则各成分的用量需按比例调整。引物混合液可以在-20℃放置2年。
注意:如果设计的LAMP引物不含Loop引物,则按上表配制时Loop引物用超纯水替代,使得总体积为100μL。引物名称 母液浓度 配制100μL
混合液所需量在20×LAMP引
物混合液中的浓度FIP引物 100μM 32μL 32μM BIP引物 100μM 32μL 32μM F3引物 100μM 4μL 4μM B3引物 100μM 4μL 4μM Loop F 100μM 8μL 8μM Loop B 100μM 8μL 8μM 自备超纯水 12μL - 测试引物的专一性:用qPCR仪器做加模板和不加模板(至少1000拷贝/反应)的荧光LAMP反应,测试每套LAMP引物的专一性。无模板反应的Ct值比有模板反应的Ct值相差越大,LAMP引物的非特异扩增就越低,专一性就越强。用户需要根据每套LAMP引物的测试结果设定该套LAMP阴性和阳性的阈值(本制品只用于定性)。如果没有qPCR仪器,只能用肉眼检测法来筛选引物,则扩增1小时后加模板的反应呈现蓝色,不加模板的反应呈现淡蓝色的引物,就可以使用。扩增后都呈现蓝色的引物,有非特异扩增,不能使用。都呈现淡蓝色的引物,没有扩增,也不能使用,上述两种情况均需要重新设计。
三、LAMP扩增(20μL体系)
- 预先将保温设备调到65℃。
- 反应设置:第一次使用时请把50μL Bst 3.0-UNG混合液加入到4×UNG-LAMP MasterMix(双染料法)中,轻柔颠倒20次充分混匀,然后再取用。如果有N+2个DNA纯化样品,则最好设置N+5个LAMP扩增,增加扩增阳性对照、无模板阴性对照、无引物无模板阴性对照各1个。在N+5个0.2mL的PCR管中按下表加入下列成分:
成分 N+2个样品管 无模板阴性对照管 扩增阳性对照管 4×UNG-LAMP MasterMix(已加酶) 各5μL 5μL 5μL 自备2 0×引物混合液 各1μL 1μL - 自备的N+2个样品DNA 1~14μL - - LAMP阳性对照模板引物混合物 - - 4μL 超纯水 至20μL 至20μL 至20μL - 如使用金属浴、水浴或普通无热盖PCR仪,则每管再加50μL自备石蜡油。如不加石蜡油,保温期间水分会蒸发,非特异扩增会增加。如果使用带热盖的PCR仪器,则不需要加石蜡油。
- 立即放到65℃并保温90分钟。如果使用荧光定量PCR仪:聚合温度设为65℃,1次循环1分钟,90个循环,每分钟在FAM通道采集一次荧光信号。
四、可视化结果分析及解读
- 扩增结束后肉眼观察结果判断阴性和阳性。典型的结果见下图:左边管为阴性,右边两个管为阳性。
- 结果分析:如果本试剂盒提供的阳性对照-引物混合物呈现阳性而阴性对照为阴性,则实验有效。如果阳性对照-引物混合物呈现阴性,则操作有问题或者试剂盒有问题,请跟厂家联系。如果阴性对照(水作为模板)也呈现阳性,则说明LAMP样品或试剂有过去的扩增产物的污染,需要注意操作的规范性,如果不能解决,可以重新设计引物扩增新的靶片段。
五、荧光染料法结果分析及解读
- 结果分析:实验有效性判定。如果两个阳性对照能够得到标准的S型扩增曲线而两个阴性对照都没有扩增,则实验有效,才有必要对样品进行分析。如果阳性对照没有出现S型扩增曲线,则说明试剂盒可能失效,实验无效。如果阴性对照有S型扩增曲线,则说明LAMP引物设计得不好,有非特异扩增,需要重新优化引物。也可能是环境或试剂有污染,实验无效。遇到实验无效的情况,请与我司联系,分析原因后再恢复实验。
- 如果实验有效,则分析样品。凡是有S扩增曲线的,可以判断为阳性。凡是没有S扩增曲线的,可以判断为阴性。典型的荧光检测结果见下图。左边为阳性结果,扩增曲线为S型,右边为阴性结果,扩增曲线不呈S型。
- 当实时荧光检测和可视化检测同时使用时,如果不一致,以实时荧光LAMP的数据为准。一般可视化结果滞后实时荧光检测结果20~30分钟,也就是说,在qPCR仪上第30分钟时呈现阳性的样品,其颜色变化在第50~60分钟时才能观察到。
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